More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2707 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  53.02 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  47.44 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 223 aa  201  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  48.17 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  45.37 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 268 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  39 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 229 aa  138  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  35.41 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  33.8 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 242 aa  122  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  31.98 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  27.92 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  30.81 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  29.73 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>