More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1565 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1565  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  418  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5382  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5471  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6046  regulatory protein GntR, HTH  34.3 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0859  regulatory protein GntR, HTH  32.68 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.774142  decreased coverage  0.0091053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5758  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10042  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  40 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  30.53 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  26.94 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0071  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  31.35 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3337  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0218222  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07250  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  44.87 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  29.84 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 252 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6204  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4089  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0077  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.672026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0596  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  33.08 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>