More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07250 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07250  transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0786463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  33.94 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  30.27 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  29.73 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  24.52 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 232 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  29.52 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  34.13 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  24.15 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3580  GntR domain protein  25.1 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  29.84 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  33.68 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  22.89 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  30.58 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  29.34 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  28.52 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  32.57 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  24.02 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  29.18 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  30 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>