More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4063 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 222 aa  118  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 266 aa  89  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 260 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 211 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  28.99 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.9 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.39 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  28.95 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  46.81 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  36.51 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  34.55 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  22.93 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  33.14 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  30.24 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.86 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>