More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5040 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  67.71 
 
 		 231 aa  295  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 233 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 233 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 233 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  41.86 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  38.43 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  35.75 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 254 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  33.84 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.19 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.96 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  34.55 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 248 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  34.08 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5540  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  34.31 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  32.98 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  31.75 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 312 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  35.96 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8476  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>