More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0770 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  79.09 
 
 		 239 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  57.96 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  55.02 
 
 		 228 aa  248  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  57.27 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  54.15 
 
 		 228 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  56.42 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  50.68 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  51.61 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  49.56 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  51.64 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  49.78 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  34.14 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.31 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  32.99 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.12 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1615  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000356607  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3435  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.478263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>