More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0677 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  49.14 
 
 		 243 aa  202  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  53.77 
 
 		 229 aa  195  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  48.57 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 228 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 239 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  34.91 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 312 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 233 aa  89.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 230 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  32.71 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.84 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  28.23 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  27.36 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 218 aa  72  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  30.46 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 230 aa  72  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  29.95 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  30.67 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  30.88 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4901  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296075  normal  0.244529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  28.86 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>