More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0705 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  55.95 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  39.21 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  36.84 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  32.87 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  29.81 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  33.19 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31.3 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 220 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0257  GntR domain protein  34.04 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>