More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2501 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 262 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  93.13 
 
 		 262 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  72.29 
 
 		 233 aa  348  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  71.81 
 
 		 236 aa  331  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  66.09 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  57.55 
 
 		 254 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  53.68 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  49.34 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  51.15 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  47.52 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  52.11 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 237 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.5 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  25.71 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  28.25 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  38.06 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4862  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556045  normal  0.353938 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3670  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0589  GntR domain protein  34.32 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>