More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1030 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2515  putative GntR family regulatory protein  32.1 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249401  normal  0.14976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2411  putative GntR family regulatory protein  32.1 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0408929  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2619  putative GntR family regulatory protein  32.1 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  normal  0.158643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2460  putative GntR family regulatory protein  32.1 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0419984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 227 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  30.15 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  29.65 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 241 aa  88.6  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.77 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  36.88 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 237 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  29.69 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>