More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3082 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  99.58 
 
 		 242 aa  473  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  95.45 
 
 		 242 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  94.19 
 
 		 241 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  93.28 
 
 		 242 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  95.87 
 
 		 242 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  95.87 
 
 		 242 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  53.18 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  51.79 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 265 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 267 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  41.2 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 396 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.7 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 226 aa  98.6  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  33.68 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 219 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 224 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 219 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 225 aa  95.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 235 aa  95.1  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 226 aa  92.8  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>