More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2937 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  52.67 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2460  putative GntR family regulatory protein  35.18 
 
 		 294 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0419984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2515  putative GntR family regulatory protein  35.18 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249401  normal  0.14976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2619  putative GntR family regulatory protein  35.18 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  normal  0.158643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2411  putative GntR family regulatory protein  35.18 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0408929  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  29.11 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  28 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  37.89 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.64 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.51 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2059  gluconate operon transcriptional repressor  29.22 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6702  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.78486 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>