More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2059 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2059  gluconate operon transcriptional repressor  100 
 
 		 226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2582  gluconate operon transcriptional repressor  73.33 
 
 		 226 aa  334  7.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.623222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2530  GntR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 226 aa  334  7.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0156  gluconate operon transcriptional repressor  46.67 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0154  gluconate operon transcriptional repressor  46.67 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0183  gluconate operon transcriptional repressor  46.67 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0162  gluconate operon transcriptional repressor  46.67 
 
 		 243 aa  235  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0161  gluconate operon transcriptional repressor  46.67 
 
 		 243 aa  235  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0205  gluconate operon transcriptional repressor  46.67 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4314  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4322  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  28.91 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  38.89 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  25.35 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  26.2 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  26.77 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  26.92 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  28.39 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  24 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  29.93 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  25.52 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  24.88 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  25.25 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  27.86 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4803  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  25 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3048  GntR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  24.3 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  25 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  24.75 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  23.86 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1628  transcriptional regulator, GntR family  24.26 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  22.55 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  23.86 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>