More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2211 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 222 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  48.4 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0589  GntR domain protein  45.18 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  36.76 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 240 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  39.33 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31340  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6785  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  32.06 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 228 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 260 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  29.08 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  28.71 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>