More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1522 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 218 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  52.38 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  35.92 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0589  GntR domain protein  45.14 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  37.65 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 251 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 260 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31340  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 257 aa  85.5  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 237 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  36.93 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.2 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0205  gluconate operon transcriptional repressor  26.7 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 264 aa  78.2  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  33.52 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0156  gluconate operon transcriptional repressor  28.4 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0154  gluconate operon transcriptional repressor  28.4 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0183  gluconate operon transcriptional repressor  28.4 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0162  gluconate operon transcriptional repressor  28.4 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0161  gluconate operon transcriptional repressor  28.4 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>