More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1104 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 232 aa  485  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.65 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.83 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.98 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 255 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  38.98 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 235 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.02 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.32 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  28.63 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 215 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  30.14 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 257 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  29.19 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 248 aa  85.1  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>