More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3106 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  47.42 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3609  transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  44.06 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19990  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 229 aa  98.2  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 228 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 251 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.73 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  28.84 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.58 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  32.68 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.66 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  36.03 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>