More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3588 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 235 aa  98.6  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  32.66 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  36.42 
 
 		 263 aa  91.7  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 262 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 221 aa  85.1  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  36.75 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  34.88 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3106  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  30.96 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.77 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  31.63 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.15 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3521  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>