More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1109 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  88.84 
 
 		 231 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  88.37 
 
 		 231 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  45.25 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 215 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  36.41 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  38.42 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  40.22 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.72 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 251 aa  74.7  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  33.53 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  24.61 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 265 aa  72  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  28.27 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>