More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5794 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  67.59 
 
 		 217 aa  289  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  52.61 
 
 		 225 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 250 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 249 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 204 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  31.07 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  32.33 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  31.32 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  28.73 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  31.69 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  31.47 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>