More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0496 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  42.58 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 231 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  42.41 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  40.84 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  40.29 
 
 		 259 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.25 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.75 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.84 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.13 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  27.13 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  34.51 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14130  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.49 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2875  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>