More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5572 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  43.36 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  43.14 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 227 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 216 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  36.41 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 217 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 204 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 226 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 263 aa  92  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 244 aa  88.6  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 		 223 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.48 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  30.11 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.36 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.06 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  40.48 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>