More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1896 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  89.11 
 
 		 204 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 250 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  40.84 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 217 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 250 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 244 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  33 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 263 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 229 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.01 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.46 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  28.82 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  27.81 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  25.13 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  25.7 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 240 aa  71.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  31.43 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  30.22 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  28.27 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>