More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3658 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  74.19 
 
 		 253 aa  298  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  55.51 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  46.5 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 233 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  39.9 
 
 		 247 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  42.72 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  43.56 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  42.16 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 216 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  39.18 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 258 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 226 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.02 
 
 		 215 aa  85.9  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  37.4 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  30.11 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  33.12 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  32.95 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  45.36 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>