More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3597 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 223 aa  300  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  54.17 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 		 226 aa  224  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2875  transcriptional regulator, GntR family  61.06 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  31.4 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 249 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 262 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 262 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 262 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  31.82 
 
 		 239 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  28.5 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  24.29 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  30.27 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  30.63 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1173  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  36.3 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>