More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0103 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  78.1 
 
 		 221 aa  337  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 232 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 267 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 233 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 229 aa  91.7  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.83 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 250 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 240 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 290 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0200  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.85 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 265 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 233 aa  84.7  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  29.05 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  34.21 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>