More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2825 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  60.29 
 
 		 228 aa  241  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3274  hypothetical protein  53.68 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00273184  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1235  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.724458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0185  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.27943  normal  0.15963 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  38.24 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5841  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.88 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 245 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  34.03 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 266 aa  72  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  28.5 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.81 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.81 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  30.33 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.61 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>