More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2049 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2049  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384927  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  82.09 
 
 		 222 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  82.09 
 
 		 220 aa  338  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 216 aa  236  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 219 aa  91.3  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2825  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0997376 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  84.7  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  33.99 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6375  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.405237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6608  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0123942 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  27.01 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  31.25 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6206  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00935659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.33 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  30.2 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>