More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6445 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  99.09 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  99.09 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  95 
 
 		 220 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6702  GntR family transcriptional regulator  93.64 
 
 		 220 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.78486 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 219 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 219 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 219 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 219 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 219 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 219 aa  298  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  34.17 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.26 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  39.04 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  30.92 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.43 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  37.41 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 241 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 241 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6117  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1967  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0532674  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  33.33 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>