More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2183 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  38.25 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  38.25 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 224 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1255  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0981  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2641  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  32.83 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  36.96 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0093  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  29.13 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0776  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2985  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 248 aa  98.2  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  33.01 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.05 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  29.05 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.25 
 
 		 221 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1572  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.91 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.247698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1703  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.91 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1753  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.91 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1706  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.91 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.160126  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1767  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.91 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2902  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>