More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2902 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2902  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  55.56 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0431  GntR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1703  GntR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4254  GntR family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4646  GntR family transcriptional regulator  56 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4698  GntR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  42.15 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3573  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3188  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4275  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4031  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4335  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6220  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2339  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 280 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1038  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1124  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4225  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3751  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0860  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3971  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0607  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0421705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2357  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  34.7 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1255  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1984  putative HTH-type transcriptional regulator  38.5 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1271  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 215 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0470  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4021  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1190  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.814536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1096  transcriptional regulator, putative  31.07 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2183  transcriptional regulator GntR  35.11 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.484217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3956  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.374286  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1074  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.605051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2417  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6054  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2281  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal  0.0140544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2196  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1536  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.25 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2101  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.98754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2209  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.25 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2056  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.25 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000144632 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01407  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.77 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01418  hypothetical protein  28.77 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1631  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.47 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1721  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  28.31 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19990  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0504  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0329427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  31.11 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7518  transcriptional regulator  35.17 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>