More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4647 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4647  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  47.62 
 
 		 240 aa  177  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  47.55 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  48.34 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 235 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 222 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 257 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 223 aa  89  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3699  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  31.79 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  37.44 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.17 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  35.86 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5785  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5768  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  29.21 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>