More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5826 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  53.53 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 226 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  29.44 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 220 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  29.36 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.48 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  29.26 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  27.15 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3930  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709239  normal  0.547681 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.84 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1206  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  26.99 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>