More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5069 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  487  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  78.02 
 
 		 244 aa  349  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  78.45 
 
 		 265 aa  348  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  56.11 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 267 aa  184  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  46.95 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  40.67 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  42.72 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 396 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  44.04 
 
 		 218 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 233 aa  111  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  39.62 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 216 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 222 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 233 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  36.18 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 221 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  38.01 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  39.38 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 231 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  34.33 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>