More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2897 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  70.54 
 
 		 232 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  61.37 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 225 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 233 aa  281  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  63.68 
 
 		 234 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  60.19 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  46.82 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  44.17 
 
 		 239 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  30.41 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  32.31 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 250 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  25.46 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  29.79 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 255 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.88 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  32.76 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  36.03 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  33.16 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.31 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  30.89 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  33.55 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>