More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4772 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  85.15 
 
 		 231 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  60.7 
 
 		 243 aa  298  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  61.99 
 
 		 238 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  62.27 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  50.46 
 
 		 238 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 238 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  48.15 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  47.51 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  32.72 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 211 aa  91.7  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 211 aa  89.4  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  27.14 
 
 		 229 aa  85.9  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  30.27 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.32 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  29.18 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  28.64 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  28.37 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  28.19 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.86 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  27.56 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  25.71 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>