More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7368 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_7368  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5277  transcriptional regulator, GntR family  51.14 
 
 
238 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4833  transcriptional regulator, GntR family  50.23 
 
 
238 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.163458 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7262  transcriptional regulator GntR family  48.17 
 
 
229 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2114  transcription regulator protein  47.11 
 
 
243 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7259  transcriptional regulator GntR family  48.4 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4824  transcriptional regulator, GntR family  49.33 
 
 
231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679029  normal  0.335762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4772  transcriptional regulator, GntR family  48.64 
 
 
235 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
243 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  44.92 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09760  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503807  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
236 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
232 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  33.17 
 
 
237 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
234 aa  95.1  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
211 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  36.3 
 
 
211 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
230 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  29.68 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 
248 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
211 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6383  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.910943 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  31.94 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
229 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  30.54 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  21.13 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 
233 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  21.13 
 
 
223 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
223 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4836  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.035326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  20.66 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  21.6 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  31.21 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  31.31 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>