More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3164 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  98.76 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  98.76 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  95.45 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  95.83 
 
 		 242 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  95.45 
 
 		 241 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  94.98 
 
 		 242 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  52.38 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 257 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1267  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  39.81 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  37.02 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 396 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  33.68 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 235 aa  98.2  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  92.8  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>