More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1479 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 256 aa  484  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 242 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 227 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 233 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 225 aa  95.5  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.7 
 
 		 226 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 238 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 225 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 232 aa  92  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  40.29 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 221 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 230 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 226 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 228 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0336  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  37.23 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  32.09 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 226 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  35.6 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 212 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  35.18 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  34.17 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>