More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5155 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  554  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  64.44 
 
 		 243 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  42.56 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 239 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  37.93 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  41.59 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  42.06 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 242 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 226 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 233 aa  92.4  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 214 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 225 aa  88.6  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 231 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 219 aa  85.9  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.35 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  34.97 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  30.45 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>