More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6983 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  64.44 
 
 		 273 aa  314  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  63.14 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 264 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  41.42 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 239 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  46.4 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  45.91 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 261 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 251 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  45.5 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  40.76 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 231 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  41.36 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  37.93 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 247 aa  115  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 218 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 217 aa  89.4  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 214 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.98 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  34.43 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 235 aa  85.5  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 224 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  39.07 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>