More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_64820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  92.41 
 
 		 237 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 244 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  74.66 
 
 		 237 aa  328  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  74.11 
 
 		 237 aa  327  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  71.24 
 
 		 237 aa  321  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  73.76 
 
 		 236 aa  320  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  71.95 
 
 		 236 aa  317  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 239 aa  294  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 231 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 240 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  42.23 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  44.61 
 
 		 257 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  41.01 
 
 		 252 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 247 aa  131  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  37.81 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  41.73 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  34.63 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.05 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3363  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.59 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.72 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  30.28 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  37.58 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  39.31 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  53.85 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>