More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3215 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  500  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  54.8 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  59.07 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  59.56 
 
 		 251 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  56.96 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  55.2 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  49.36 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  58.56 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  44.22 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  44.13 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  43.19 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 238 aa  151  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 237 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  46.26 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  45.79 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 238 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 237 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 227 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 293 aa  88.6  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  40.25 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 227 aa  86.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 275 aa  86.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 		 223 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  38.28 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.33 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  30.48 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  27.39 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>