More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2134 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  63.14 
 
 		 243 aa  288  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 273 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 261 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  49.26 
 
 		 237 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  48.77 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  41.3 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  43.9 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  41.81 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  42.93 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  36.09 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 252 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 235 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  38.62 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  32.59 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  35.33 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  40.94 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  35.76 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  29.58 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>