More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1138 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  59.34 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  56.43 
 
 		 264 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  57.26 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  60 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  59.07 
 
 		 256 aa  252  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  59.91 
 
 		 251 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  55.51 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  52.12 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  49.36 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 273 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 238 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  44.33 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  43.35 
 
 		 237 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  38.32 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  38.64 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  34.63 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  40.88 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  32.7 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  45.26 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>