More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6551 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  55.84 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 256 aa  222  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  52.12 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  47.68 
 
 		 251 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  48.95 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 264 aa  191  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5155  GntR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6983  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1295  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1336  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0345  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  36.59 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3788  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  37.81 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2710  transcriptional regulator GntR  35.78 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0839086  normal  0.32208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0535  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 232 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 231 aa  92  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 226 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 229 aa  85.9  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.55 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>