More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 229 aa  460  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  55.95 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  53.77 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  36.32 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 260 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 243 aa  85.1  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  30.62 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 216 aa  72  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4855  GntR domain-containing protein  27.36 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  31.73 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5342  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.912563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  28.83 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  30.56 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  34.16 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0180  transcriptional regulator, GntR family  34.46 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  32.51 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>