More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2372 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  46.92 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 396 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2059  gluconate operon transcriptional repressor  26.92 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 219 aa  88.6  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2582  gluconate operon transcriptional repressor  28.43 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.623222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2530  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 250 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 238 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  41.61 
 
 		 269 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 262 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4314  transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4322  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2549  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000803432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5629  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4903  transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  32.97 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  30 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64820  putative transcriptional regulator  32.85 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00305784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  31.33 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>