More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4903 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4903  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 243 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 231 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  29.14 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  32.72 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  41.04 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7250  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  28.9 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  31.36 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.76 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  37.68 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6445  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6702  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.78486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.06 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5579  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5943  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3443  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  41.76 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  38.53 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  37.86 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3853  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000435819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>