More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4314 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4314  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4322  transcriptional regulator, GntR family  61.3 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0156  gluconate operon transcriptional repressor  30.88 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0154  gluconate operon transcriptional repressor  30.88 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0205  gluconate operon transcriptional repressor  30.88 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0183  gluconate operon transcriptional repressor  30.88 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0162  gluconate operon transcriptional repressor  30.88 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0161  gluconate operon transcriptional repressor  30.88 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2059  gluconate operon transcriptional repressor  29.13 
 
 		 226 aa  87  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2582  gluconate operon transcriptional repressor  27.23 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.623222  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2530  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  41.11 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 219 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 229 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  34.59 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3853  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000435819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  39.77 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2382  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  0.779059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1449  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  29.18 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  50.63 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  46.07 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  43.9 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2460  putative GntR family regulatory protein  28.17 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0419984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2619  putative GntR family regulatory protein  28.17 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  normal  0.158643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2515  putative GntR family regulatory protein  28.17 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249401  normal  0.14976 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2411  putative GntR family regulatory protein  28.17 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0408929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1479  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  33.57 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.19 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  36.23 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.47 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  32.61 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>